PortainerでJupyter LabとPostgreSQLのスタックを作成する

Jupyter Notebookでインタラクティブなコンピューティング環境を提供する事ができます。Portainerで簡単にwebブラウザからJupyter LabとPostgreSQLのスタックを作成する事ができます。

○Jupyter Labの画面

〇構築方法
1.Portainer画面横のImagesをクリックして、Image list画面からBuild a new imageボタンをクリック

2.Build image画面nameフィールドにmyjupyter-pgを入力

3.Web editorのテキストエリアに以下を貼り付け

FROM jupyter/scipy-notebook
ENV TZ=Asia/Tokyo
USER root
RUN apt-get update \
  && apt-get -y install libpq-dev python-dev python-pip \
  && pip install psycopg2-binary \
  && apt-get clean
USER $NB_UID

貼り付け後、build the image ボタンをクリックします。

4.画面横のStacksをクリック後、Stacks list画面でAdd a stackボタンをクリックします

5.Create stack画面で、Nameフィールドにjupyterlab-pg-stackを入力し、Web editorに以下を張り付ける

version: "3"
services:
  scipy-notebook:
    image: myjupyter-pg
    container_name: "myjupyter-pg"
    volumes:
      - "myjupyter-data:/home/jovyan/work"
    ports:
      - "8888:8888"
    environment:
      JUPYTER_TOKEN: jupyter
      JUPYTER_ENABLE_LAB: 1
    depends_on:
      - jupyterdb
  jupyterdb:
    image: postgres:10.4-alpine
    container_name: "test-db"
    ports:
      - "5432:5432"
    volumes:
      - "jupyterdb-data:/var/lib/postgresql/data"
    environment:
        POSTGRES_DB: test
        POSTGRES_PASSWORD: test
volumes:
  jupyterdb-data:
    driver: local
  myjupyter-data:
    driver: local

貼り付け後、deploy stackボタンをクリックします。

6.ブラウザから以下のURLにアクセス
http://<Dockerホスト名またはIP>:8888/?token=jupyter

〇動作検証用コード

import psycopg2

con = psycopg2.connect("dbname=test host=jupyterdb user=postgres password=test")

try:
  cur= con.cursor()

  cur.execute("create table messages (message_id integer, message varchar(100))")
  cur.execute("insert into messages values (100, 'hello world!')")

  sql = "select message_id, message from messages"
  cur.execute(sql)

  for row in cur.fetchall():
    print(row)

except psycopg2.Error as er:
    print('psycopg2.Error:', er)
cur.close
con.close

○関連情報
・psycopg2に関する他の記事はこちらを参照してください。

・Portainerに関する他の記事はこちらを参照してください。