dockerでJupyter Notebook、MariaDBがインストールされたコンテナのイメージを作成する

Jupyter Notebookでインタラクティブなコンピューティング環境を提供する事ができます。
以下の手順で、Jupyter Notebook、MariaDBのコンテナを構築・実行します。

○構築方法
1. mysqlclientを追加したJupyter Notebookイメージの作成(Dockerfileがあるフォルダで実行)

docker build -t scipy-notebook-mariadb .

Dockerfile

FROM jupyter/scipy-notebook
ENV TZ=Asia/Tokyo
USER root
RUN apt-get update \
  && apt-get -y install apt-file \
  && apt-get -y install software-properties-common \
  && apt-key adv --recv-keys --keyserver hkp://keyserver.ubuntu.com:80 0xF1656F24C74CD1D8 \
  && add-apt-repository 'deb [arch=amd64,i386,ppc64el] http://ftp.yz.yamagata-u.ac.jp/pub/dbms/mariadb/repo/10.2/ubuntu xenial main' \
  && apt-get update \
  && apt-get -y install libmariadbclient-dev \
  && pip install mysqlclient \
  && apt-get clean
USER $NB_UID

2. Jupyter NotebookとMySQLコンテナの構築・実行(docker-compose.ymlがあるフォルダで実行)

docker-compose up -d

docker-compose.yml

version: "2"
services:
  scipy-notebook:
    image: scipy-notebook-mariadb
    container_name: "scipy-notebook-mariadb"
    volumes:
      - "scipy-notebook-data:/home/jovyan/work"
    ports:
      - "8888:8888"
    environment:
      JUPYTER_TOKEN: jupyter
    depends_on:
      - db
  db:
    image: mariadb:10.2
    command: mysqld --character-set-server=utf8mb4 --collation-server=utf8mb4_unicode_ci
    container_name: "scipy-notebook-db"
    volumes:
      - "db-data:/var/lib/mysql"
    ports:
      - "3306:3306"
    environment:
        MYSQL_DATABASE: test
        MYSQL_ROOT_PASSWORD: test
volumes:
  db-data:
    driver: local
  scipy-notebook-data:
    driver: local

※Jupyter Labを使用したい場合は、以下のようにenvironmentにJUPYTER_ENABLE_LAB: 1を追加します。

    environment:
      JUPYTER_TOKEN: jupyter
      JUPYTER_ENABLE_LAB: 1

3.ブラウザから以下のURLにアクセス
http://<Dockerホスト名またはIP>:8888/?token=jupyter

○動作確認用コード

import MySQLdb

con = MySQLdb.connect(
  user='root',
  passwd='test',
  host='db',
  db='test')

try:
  cur= con.cursor()
  cur.execute("create table messages (message_id integer, message varchar(100))")
  cur.execute("insert into messages values (100, 'hello world!')")
  sql = "select message_id, message from messages"
  cur.execute(sql)

  for row in cur.fetchall():
    print(row)

except MySQLdb.Error as er:
    print('MySQLdb.Error:', er)
cur.close
con.close

○Jupyter Notebookの画面