DockerでJupyter Notebook、PostgreSQL10.5がインストールされたコンテナのイメージを作成する

Jupyter Notebookでインタラクティブなコンピューティング環境を提供する事ができます。

○Jupyter Notebookの画面

○構築方法
以下の手順で、Jupyter Notebook、PostgreSQL10.5のコンテナを構築・実行します。
1. psycopg2を追加したJupyter Notebookイメージの作成(Dockerfileがあるフォルダで実行)

docker build -t scipy-notebook-pg .

Dockerfile

FROM jupyter/scipy-notebook
ENV TZ=Asia/Tokyo
USER root
RUN apt-get update \
  && apt-get -y install libpq-dev python-dev \
  && pip install psycopg2-binary \
  && apt-get clean
USER $NB_UID

2. Jupyter NotebookとPostgreSQLコンテナの構築・実行(docker-compose.ymlがあるフォルダで実行)

docker-compose up -d

docker-compose.yml

version: "2"
services:
  scipy-notebook:
    image: scipy-notebook-pg
    container_name: "scipy-notebook-pg"
    volumes:
      - "scipy-notebook-data:/home/jovyan/work"
    ports:
      - "8888:8888"
    environment:
      JUPYTER_TOKEN: jupyter
    depends_on:
      - db
  db:
    image: postgres:10.5-alpine
    container_name: "test-db"
    ports:
      - "5432:5432"
    volumes:
      - "db-data:/var/lib/postgresql/data"
    environment:
        POSTGRES_DB: test
        POSTGRES_PASSWORD: test
volumes:
  db-data:
    driver: local
  scipy-notebook-data:
    driver: local

※Jupyter Labを使用したい場合は、以下のようにenvironmentにJUPYTER_ENABLE_LAB: 1を追加します。

    environment:
      JUPYTER_TOKEN: jupyter
      JUPYTER_ENABLE_LAB: 1

3.ブラウザから以下のURLにアクセス
http://<Dockerホスト名またはIP>:8888/?token=jupyter

〇動作検証用コード

import psycopg2

con = psycopg2.connect("dbname=test host=db user=postgres password=test")

try:
  cur= con.cursor()

  cur.execute("create table messages (message_id integer, message varchar(100))")
  cur.execute("insert into messages values (100, 'hello world!')")

  sql = "select message_id, message from messages"
  cur.execute(sql)

  for row in cur.fetchall():
    print(row)

except psycopg2.Error as er:
    print('psycopg2.Error:', er)
cur.close
con.close

○関連情報
・psycopg2に関する他の記事はこちらを参照してください。