LXDでJupyter LabとMariaDBがインストールされたコンテナ(Ubuntu18.04)を構築する

Jupyter Labでインタラクティブなコンピューティング環境を提供する事ができます。

〇Jupyter Labの画面

ブラウザでhttp://<ホスト名またはIPアドレス>:8888/?token=jupyterにアクセスします。

コンテナの構築

LXDで以下のコマンドを実行して、JupyterLabとMariaDBがインストールされたコンテナ(Ubuntu18.04)を構築します。

lxc init ubuntu:18.04 ub1804jupyterlabmariadb
lxc config set ub1804jupyterlabmariadb user.user-data - < config.yml
lxc start ub1804jupyterlabmariadb

config.yml

#cloud-config

package_upgrade: true

hostname: ub1804jupyterlabmariadb
manage_etc_hosts: true

write_files:
  - path: /etc/systemd/system/jupyter.service
    content: |
      [Unit]
      Description=Jupyter notebook
      [Service]
      Type=simple
      EnvironmentFile=/opt/anaconda/bin/activate
      ExecStart=/opt/anaconda/bin/jupyter lab
      User=py
      Group=py
      WorkingDirectory=/home/py
      Restart=always
      RestartSec=10
      [Install]
      WantedBy=multi-user.target
  - path: /tmp/jupyter_notebook_config.py
    content: |
      conf = get_config()
      conf.NotebookApp.ip = '*'
      conf.NotebookApp.open_browser = False
      conf.NotebookApp.port = 8080
      conf.NotebookApp.token = 'jupyter'

runcmd:
  - 'apt-get update'
  - 'locale-gen ja_JP.UTF-8'
  - 'localectl set-locale LANG=ja_JP.UTF-8'
  - 'echo "mariadb-server-10.0 mysql-server/root_password password root" | sudo debconf-set-selections'
  - 'echo "mariadb-server-10.0 mysql-server/root_password_again password root" | sudo debconf-set-selections'
  - 'apt-get -y install mariadb-server'
  - 'mysql -uroot -proot -e "CREATE DATABASE test DEFAULT CHARACTER SET utf8mb4;"'
  - "mysql -uroot -proot -e \"CREATE USER test@localhost IDENTIFIED BY 'test';\""
  - "mysql -uroot -proot -e \"GRANT ALL PRIVILEGES ON test.* TO 'test'@'localhost';\""
  - 'mysql -uroot -proot -e "FLUSH PRIVILEGES;"'
  - 'mysql -utest -ptest test -e "create table messages (message_id integer not null, message varchar(100));"'
  - "mysql -utest -ptest test -e \"insert into messages value (1, 'hello world.');\""
  - "mysql -utest -ptest test -e \"insert into messages value (2, 'test message.');\""
  - "wget https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh"
  - "chmod +x Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh"
  - "./Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh -b -p /opt/anaconda"
  - "/bin/bash -c 'source /opt/anaconda/bin/activate && pip install jupyterlab'"
  - "apt-get -y install libmariadbclient-dev gcc"
  - "/bin/bash -c 'source /opt/anaconda/bin/activate && pip install mysqlclient'"
  - "useradd py"
  - "mkdir -p /home/py"
  - "chown -R py:py /home/py"
  - 'sudo -u py bash -c "mkdir /home/py/.jupyter"'
  - 'sudo -u py bash -c "cp /tmp/jupyter_notebook_config.py /home/py/.jupyter/jupyter_notebook_config.py"'
  - "sudo systemctl enable jupyter"
  - "sudo systemctl start jupyter"
final_message: "completed."

〇コンテナに入る

lxc exec ub1804jupyterlabmariadb /bin/bash

〇ホストマシンの外部からコンテナにアクセスしたい場合
以下のコマンドを実行します。

PORT=8080 PUBLIC_IP=<ホストのIP> CONTAINER_IP=<コンテナのIP> sudo -E bash -c 'iptables -t nat -I PREROUTING -i eth0 -p TCP -d $PUBLIC_IP --dport $PORT -j DNAT --to-destination $CONTAINER_IP:$PORT -m comment --comment "container"'

〇コンテナのIPを調べる
コンテナのIPは以下のコマンドで調べることができます。

lxc list

〇コンテナの停止

lxc stop ub1804jupyterlabmariadb

〇コンテナの削除

lxc delete ub1804jupyterlabmariadb

○動作確認用コード

import MySQLdb

con = MySQLdb.connect(
  user='test',
  passwd='test',
  host='localhost',
  db='test')

try:
  cur= con.cursor()
  sql = "select message_id, message from messages"
  cur.execute(sql)

  for row in cur.fetchall():
    print(row)

except MySQLdb.Error as er:
    print('MySQLdb.Error:', er)
cur.close
con.close

関連情報

・Jupyterに関する他の情報はこちらを参照してください。